Para implementar el componente de auditoría, el Ministerio de Salud y Protección Social ha definido una ruta crítica compuesta por nueve pasos, que me permiten de una manera ordenada avanzar hacia estándares superiores de calidad.

Antes de iniciar la ruta crítica se recomienda sensibilizar los miembros de la organización en el proceso que se va a iniciar, identificar y seleccionar las personas que harán parte de los equipos de autoevaluación y mejoramiento, conceptualizar a los miembros de la institución en los elementos estructurales de la metodología PAMEC, definir funciones de los equipos de mejoramiento, diseñar los instrumentos para la implementación de la ruta crítica, formato de autoevaluación, de priorización, de desarrollo de planes de mejoramiento entre otros, preparar la logística de las reuniones, realizar un cronograma de implementación de la ruta crítica que permita determinar tiempos, actividades.